Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MAT1AQ00266 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms