Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ACTA1P68133 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms