Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVPABLB-1P60509 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms