Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DCDC1P59894 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DCDC1P59894 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms