Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EEFSECP57772 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EEFSECP57772 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms