Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CLDN17P56750 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms