Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TPTEP56180 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TPTEP56180 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPTEP56180 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPTEP56180 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPTEP56180 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPTEP56180 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPTEP56180 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPTEP56180 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPTEP56180 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPTEP56180 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPTEP56180 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPTEP56180 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPTEP56180 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPTEP56180 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPTEP56180 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPTEP56180 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TPTEP56180 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPTEP56180 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPTEP56180 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPTEP56180 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPTEP56180 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPTEP56180 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TPTEP56180 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TPTEP56180 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms