Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP7P55210 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CASP7P55210 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP7P55210 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CASP7P55210 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CASP7P55210 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CASP7P55210 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms