Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FOSBP53539 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FOSBP53539 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FOSBP53539 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FOSBP53539 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FOSBP53539 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FOSBP53539 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FOSBP53539 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FOSBP53539 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FOSBP53539 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FOSBP53539 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms