Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSEN1P49768 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms