Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT3P49368 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCT3P49368 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCT3P49368 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CCT3P49368 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT3P49368 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCT3P49368 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCT3P49368 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCT3P49368 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT3P49368 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT3P49368 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT3P49368 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT3P49368 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCT3P49368 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT3P49368 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT3P49368 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCT3P49368 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCT3P49368 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCT3P49368 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCT3P49368 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT3P49368 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCT3P49368 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms