Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGM4P49221 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGM4P49221 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TGM4P49221 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TGM4P49221 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TGM4P49221 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TGM4P49221 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TGM4P49221 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms