Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms