Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GRIA4P48058 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms