Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT2P45379 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT2P45379 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms