Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTGER2P43116 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER2P43116 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms