Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGFBR1P36897 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms