Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXA13P31271 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms