Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GTF2E1P29083 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms