Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms