Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PTPRDP23468 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRDP23468 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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