Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CAPN3P20807 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms