Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCP1P17987 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TCP1P17987 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCP1P17987 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCP1P17987 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TCP1P17987 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TCP1P17987 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TCP1P17987 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCP1P17987 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCP1P17987 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCP1P17987 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCP1P17987 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCP1P17987 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCP1P17987 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCP1P17987 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCP1P17987 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCP1P17987 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCP1P17987 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCP1P17987 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCP1P17987 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCP1P17987 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCP1P17987 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCP1P17987 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCP1P17987 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCP1P17987 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCP1P17987 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCP1P17987 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCP1P17987 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TCP1P17987 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms