Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GNB3P16520 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GNB3P16520 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNB3P16520 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNB3P16520 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms