Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTLA4P16410 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTLA4P16410 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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