Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC166P0CW27 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms