Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSF1P09603 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSF1P09603 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSF1P09603 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSF1P09603 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms