Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMBP08118 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MSMBP08118 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms