Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPBO95292 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPBO95292 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPBO95292 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPBO95292 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPBO95292 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPBO95292 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPBO95292 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPBO95292 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPBO95292 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPBO95292 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPBO95292 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VAPBO95292 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAPBO95292 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAPBO95292 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAPBO95292 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
VAPBO95292 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAPBO95292 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAPBO95292 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAPBO95292 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VAPBO95292 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPBO95292 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPBO95292 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPBO95292 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPBO95292 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPBO95292 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPBO95292 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPBO95292 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPBO95292 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPBO95292 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPBO95292 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPBO95292 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPBO95292 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPBO95292 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPBO95292 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPBO95292 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPBO95292 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPBO95292 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VAPBO95292 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VAPBO95292 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VAPBO95292 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms