Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSX5O60225 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSX5O60225 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms