Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1GO43497 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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