Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PSMD3O43242 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PSMD3O43242 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PSMD3O43242 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PSMD3O43242 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD3O43242 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD3O43242 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD3O43242 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD3O43242 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD3O43242 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD3O43242 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD3O43242 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSMD3O43242 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms