Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF113AO15541 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF113AO15541 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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