Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BCKDKO14874 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BCKDKO14874 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms