Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SOCS6O14544 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms