Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BHLHE40O14503 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms