Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SRRM4A7MD48 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms