Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRGMA1A4Y4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms