Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LYVE1Q9Y5Y7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms