Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMED5Q9Y3A6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms