Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP22Q9UPT9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms