Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC12A4Q9UP95 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A4Q9UP95 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms