Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms