Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHORDC1Q9UHD1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms