Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIS18AQ9NYP9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms