Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CWC25Q9NXE8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CWC25Q9NXE8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms