Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASF1BQ9NVP2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms