Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TM7SF3Q9NS93 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms