Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC1Q9NRX5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms