Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMYD2Q9NRG4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms